بدأت جامعة القاهرة بأربع كليات هى الآداب والعلوم والطب والحقوق عند صدور مرسوم إنشاء الجامعة المصرية فى ١ مارس 1925 وفى نفس العام تم ضم مدرسة الصيدلة لكلية الطب.. وكانت تحمل اسم الجامعة الأهلية سنة 1908 وكان أول رئيس لها أستاذ الجيل أحمد لطفى السيد.. وكان محمد علوى باشا أول رئيس للجامعة المصرية 1925.
وفى 22 أغسطس سنة 1935 اصدر المرسوم الملكى بقانون رقم 91 بضم مدارس الهندسة والزراعة والتجارة والطب البيطرى إلى الجامعة. وفى 31 أكتوبر 1935 تقرر ضم معهد الأحياء المائية للجامعة.
ـ وفى 1938 انفصلت مدرسة الطب البيطرى عن كلية الطب وأصبحت كلية مستقلة.
ـ وفى 24 أبريل 1946 تقرر ضم مدرسة دار العلوم وأصبحت إحدى كليات الجامعة.
ـ وفى سنة 1955 تحول قسم الصيدلة بكلية الطب إلى كلية مستقلة، وقسم طب الفم والأسنان إلى كلية مستقلة.
ـ وفى نفس العام أنشئ فرع الجامعة بالخرطوم.
ـ بدأت الدراسة بكلية الاقتصاد والعلوم السياسية فى العام الجامعى 1961-1960.
ـ 1962 أنشئ معهد الدراسات والبحوث الإحصائية ومعهد العلاج الطبيعى الذى تحول إلى كلية فى يناير 1962.
ـ فى 1964 أنشئ المعهد العالى للتمريض «ملحق بكلية الطب» تحول إلى كلية للتمريض سنة 2000.
ـ 1969 أنشئ المعهد القومى للأورام.
ـ 1970 بدأت الدراسة بمعهدى الإعلام والآثار بعد انفصالهما عن كلية الآداب ثم تحولا إلى كليتين مستقلتين.
ـ 1979 أنشئ معهد التخطيط الإقليمى والعمرانى وتحول إلى كلية منذ 1991.
ـ 1987 أنشئ معهد البحوث والدراسات التربوية.
ـ 12 سبتمبر 1994 المعهد القومى لعلوم الليزر «أول معهد فى العالم العربي».
ـ 1996 أنشئت كلية الحاسبات والمعلومات.
وتواصل بعد ذلك إنشاء العديد من الكليات والأقسام الجديدة حتى الآن وفقاً للتطور العلمى والتكنولوجى الذى تساير فيه الجامعة أحدث مناهج التعليم فى جامعات العالم وبما يتوافق مع متطلبات التعليم فى مصر ورؤية ارتباطه بسوق العمل.
> ومن الجدير بالذكر أنه أنشئت كلية طب العباسية بالإضافة إلى كلية الطب الأولى «قصر العيني» وضمت إلى جامعة عين شمس منذ إنشائها سنة 1950 وكانت تسمى جامعة إبراهيم.
ـ بدأ فرع جامعة القاهرة بالمنصورة بكلية الطب سنة 1964 واستقل تحت اسم جامعة المنصورة سنة 1973.
ـ فى سنة 1950 تقرر ضم مرصد حلوان للجامعة واستقل معهد الأحياء المائية باسم معهد علوم البحار، كما استقل مرصد حلوان، باسم معهد الأرصاد الفلكية.
ـ كما استقل معهد الدراسات السودانية عن كلية الآداب.
ـ 1952 أنشئ معهد العلوم السياسية وتقرر ضم معهد العلوم السياسية وتقرر ضم الوثائق والمكتبات للجامعة.
ـ فى سنة 1954 تقرر ضم المعاهد المستقلة إلى الكليات كأقسام بها فى معهد العلوم السياسية لكلية الحقوق ومعهد الأرصاد ومعهد علوم البحار بكلية العلوم ومعهدى الوثائق والمكتبات والدراسات السودانية لكلية الآداب مع تعديل اسم معهد الدراسات السودانية إلى معهد الدراسات الأفريقية.
كما استقل فرعا الجامعة بالفيوم وبنى سويف سنة 2005.
كما تم ضم كليتى التربية النوعية ورياض الأطفال إلى الجامعة سنة 1998 ليصل عدد كلياتها ومعاهدها فى ذلك الوقت إلى 24 كلية ومعهداً.